1、这里的“收入”为不含增值税的收入。
2、依据财税(2006)021号文要求，各地要进一步完善土地增值税预征办法，根据本地区房地产业增值水平和市场发展情况，区别普通住房、非普通住房和商用房等不同类型，科学合理地确定预征率，并适时调整。工程项目竣工结算后，应及时进行清算，多退少补。对未按预征规定期限预缴税款的，应根据《税收征管法》及其实施细则的有关规定，从限定的缴纳税款期限届满的次日起，加收滞纳金。所以你们公司应该按照规定的期限预交土地增值税，没有预交的面临税务风险，预缴后在土地增值税清算后扣除预交的土地增值税。
3、土地增值税收入问题：
土地增值税清算时销售收入的确认
● 土地增值税清算时，已全额开具商品房销售发票的，按照发票所载金额确认收入；
● 未开具发票或未全额开具发票的，以交易双方签订的销售合同所载的售房金额及其他收益确认收入；
因为你们对于预收房款尚未做账确认收入，所以预收房款应当在土地增值税清算时需要调增收入，注意换算为不含税收入计入。
好了仅供参考，具体以国家和地方相关规定为准。
